本區共轄16里(2018年後，溪州及營頂合併為營溪里、禮化及佳化合併為佳興里、三協及子龍合併為子龍里、漳洲及海澄合併為海澄里、頂廍及嘉福合併為下營里、通興.蚶寮.龍安合併為塭內里、安西切分為安西里及文新里、建南切分為建南里及南勢里)，因歷史與地緣關係可劃分為五個地區，每個地區設有一警察派出所，隸屬於佳里分局。
佳里地區：六安里（區公所）、安西里、忠仁里、東寧里、建南里、南勢里、鎮山里、文新里
（佳里市區，角頭：東勢角、潭墘、大路尾、南勢、三五甲）
子龍地區：子龍里、民安里
（子龍廟、同安寮、新宅、後莊、潭墘、菜寮）
塭內地區：塭內里
（塭子內、外渡頭、林投內、蚶寮、埔頂、東勢寮、港墘）
延平地區：下營里、海澄里
（下營(頂下廍)、番子寮、北頭洋、萊竿寮、後港腳）
佳興地區：佳化里、佳興里、營溪里
（佳里興（細分：頭前許、後壁曾、潭仔墘）、蘇厝寮、營頂、溪州）